Диагностика ОРВИ и Гриппа А/Б: Респираторно-синцитиальный вирус, метапневмовирус, вирусы парагриппа 1, 2, 3, 4 типов, коронавирусы ОС43, Е229, NL63, HKUI (hCov), риновирусы, аденовирусы групп Б, С, Е, бокавирус, вирусы гриппа А/B, обнаружение РНК

Мультиплексное ПЦР-исследование, используемое для выявления РНК наиболее частых возбудителей острых респираторно-вирусных инфекций (ОРВИ) (респираторно-синцитиальный вирус, метапневмовирус, вирусы парагриппа 1, 2, 3, 4 типов, коронавирусы ОС43, Е229, NL63, HKUI (hCov), риновирусы, бокавирус), вирусов гриппа A/B и ДНК аденовирусов групп Б, С, Е методом ПЦР Real time в пробе пациента. Формат исследования — качественный.

Помимо вирусов гриппа A/B, в популяции людей циркулируют еще 17 видов вирусов семи семейств, которые вызывают ежегодный эпидемический подъем заболеваемости ОРВИ различной интенсивности:

• респираторно-синцитиальный вирус человека (Human Orthopneumovirus, ранее называвшийся Human Respiratory Syncytial virus), по современной классификации относится роду Orthopneumovirus, метапневмовирус человека (Human Metapneumovirus) – к роду Metapneumovirus cемейства Pneumoviridae;
• в cемействе парамиксовирусов (Paramyxoviridae) выделяют подсемейство Orthoparamyxovirinae, род Respirovirus, к которому относят Human Respirovirus 1 (ранее называвшийся – Human Paraininfluenzavirus 1, распространенное название – вирус парагриппа 1) и Human Respirovirus 3 (ранее – Human Parainfluenzavirus 3, распространенное название – вирус парагриппа 3), и подсемейство Rubulavirinae, род Orthorubulavirus, к которому относят Human Orthorubulavirus 2 (ранее – Human Parainfluenzavirus 2, распространенное название – вирус парагриппа 2) и Human Orthorubulavirus 4 (ранее – Human Parainfluenzavirus 4, распространенное название – вирус парагриппа 4);
• аденовирусы принадлежат к роду Mastadenovirus, в котором выделяют 7 видов (Human mastadenovirus A – G), и на основании данных иммунологических исследований, гомологии ДНК и филогенетического анализа – более 60 серотипов аденовируса человека;
• среди бокавирусов, циркулирующих в популяции людей, выделяют 2 вида: один из которых – Primate bocaparvovirus 1, ранее называвшийся Human bocavirus, вызывает ОРВИ, второй вид – Primate bocaparvovirus 2 ассоциируют с острыми кишечными инфекциями. Оба вируса относятся к семейству Parvoviridae, подсемейству Parvovirinae, роду – Bocaparvovirus;
• среди представителей семейства коронавирусов (Coronaviridae), вызывающих ОРВИ и циркулирующих среди людей, выделяют четыре вида. Human coronavirus 229E принадлежит к роду Alphacoronavirus подроду Duvinacovirus, Human coronavirus NL63 относится к подроду Setracovirus, Human coronavirus HKU1 и Betacoronavirus 1 принадлежат к роду Betacoronavirus подроду Embecovirus;
• среди риновирусов, инфицирующих людей, в настоящее время выделяют 3 вида: Rhinovirus A, B и C, которые относятся к роду Enterovirus семейства Picornaviridae.

Все вышеперечисленные вирусы, за исключением бокавируса человека, вызывают заболевания у всех возрастных групп. Бокавирус обнаруживается только у больных ОРВИ детей и иммунокомпрометированных взрослых. У лиц со сниженной активностью иммунной системы ОРВИ могут вызывать также энтеровирусы, вирусы герпеса, в том числе цитомегаловирус.

Возбудители гриппа – РНК-содержащие вирусы, относятся к семейству Ortomyxoviridae, в котором выделяют три рода – Alphainfluenzavirus, Betainfluenzavirus и Gammainfluenzavirus, каждый из которых имеет по одному виду - Influenza A virus, Influenza В virus и Influenza С virus, соответственно. Вирусы гриппа А и В ежегодно вызывают эпидемии большей или меньшей интенсивности во всех странах мира Северного и Южного полушария волнообразно. Вирусы гриппа А (Influenza A virus) широко распространены в природе, их выделяют от большинства зверей и птиц, в связи с чем они имеют высокий пандемический потенциал, так как способны преодолевать межвидовые барьеры и подвержены явлению реассортации (обмена сегментами генома). Считается, что вирусы гриппа В (Influenza В virus) инфицируют только людей. Вирусы гриппа С (Influenza С virus) выделяют от людей и свиней. Вирусы гриппа А, В и С дифференцируют друг от друга с помощью иммунологических и молекулярно-биологических методов.

Этиологическая диагностика ОРВИ достаточно сложна. Наиболее распространенными являются обнаружения возбудителя в слизи зева и носа методом РИФ или РНИФ при помощи флюоресцирующих антител и серологический. Серологическая диагностика чаще используется для ретроспективной этиологической диагностики (РНГА, РПГА). В последнее время для этиологической диагностики всё чаще применяется метод ПЦР: обнаружение ДНК или РНК возбудителя в мазках из носа, ротоглотки, слюне, мокроте и т. п. Наиболее широко для этиологической диагностики ОРВИ и гриппа применяют методы амплификации нуклеиновых кислот (МАНК), особенно – ПЦР Real time. В настоящее время МАНК является единственной возможностью диагностики инфекций, вызванных метапневмовирусом, эпидемическими коронавирусами, вирусом парагриппа 4, бокавирусом человека и разнообразными риновирусами. Для быстрой этиологической диагностики ОРВИ используется выявление РНК/ДНК вирусов методом ПЦР с детекцией в режиме «реального времени».

• Клиническая картина ОРВИ, гриппа.
• Дифференциальная диагностика с гриппом.
• Эпидемиологические исследования.

Специальной подготовки не требуется.

Мазок из носа, мазок из ротоглотки – Материал получают сухим стерильным ватным тампоном на палочке. После взятия материала поместить тампон в пробирку с транспортной средой, аккуратно прополоскать в среде для отделения материала, отжать остатки среды о стенки пробирки, тампон удалить, пробирку закрыть, указать на пробирке Ф.И.О. пациента и дату взятия материала. Обязательно указать в направлении Ф.И.О. пациента, номер пробирки, вид материала и необходимое исследование. Мокрота, бронхоальвеолярный лаваж, плевральная жидкость – Собирается в сухой стерильный контейнер. Закрыть контейнер, на этикетке указать Ф.И.О. пациента и дату взятия материала. Обязательно указать в направлении Ф.И.О. пациента, вид материала и необходимое исследование. До передачи курьеру, материал может храниться в холодильнике при температуре + 2 - +8ºС.

Мазок из носа, мазок из ротоглотки, зева, мокрота, бронхоальвеолярный лаваж, плевральная жидкость

ПЦР Real time

Единицы измерения: тест качественный

РНК/ДНК (наименование возбудителя)

• обнаружена: инфицирование данным возбудителем.
• не обнаружена: нет инфицирования данным возбудителем.

Данное комплексное исследование позволяет обнаружить РНК наиболее частых возбудителей острых респираторно-вирусных инфекций (ОРВИ) (респираторно-синцитиальный вирус, метапневмовирус, вирусы парагриппа 1, 2, 3, 4 типов, коронавирусы ОС43, Е229, NL63, HKUI (hCov), риновирусы, бокавирус), вирусов гриппа A/B и ДНК аденовирусов групп Б, С, Е.

G101 Вирус SARS-CoV-2, вирусы гриппа A и B (Ihfluenza virus A/B), обнаружение РНК; G156 Вирусы гриппа A (Influenza virus A) и гриппа B (Influenza virus B), обнаружение РНК

1. Яцышина С.Б. Грипп. // Лабораторная диагностика инфекционных болезней. Под ред. Акимкина В.Г., Твороговой М.Г. - Москва. ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора, 2020: 238-241.
2. Яцышина С.Б., Агеева М.Р. Острые респираторные вирусные инфекции. // Лабораторная диагностика инфекционных болезней. Под ред. Акимкина В.Г., Твороговой М.Г. - Москва. ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора, 2020: 241-249.
3. Charlton C.L., Babady E., Ginocchio C., et al. Practical Guidance for Clinical Microbiology Laboratories: Viruses Causing Acute Respiratory Tract Infections. /Clin Microbiol Rev. 2018 Dec 12; 32(1):e00042-18.
4. Gaitonde D.Y., Moore F., Morgan M.K. Influenza: Diagnosis and Treatment. /Am Fam Physician. 2019 Dec 15; 100(12):751-758.
5. Maeda Y., Horimoto T., Kawaoka Y. [Classification and genome structure of influenza virus]. /Nihon Rinsho. 2003 Nov; 61(11):1886-1891.