Комплексное исследование, позволяющее одновременно обнаружить и типировать ДНК диарогенных E. coli: энтеропатогенных (EPEC); энтеротоксигенных (ETEC); энтероинвазивных (EIEC); энтерогеморрагических (EHEC); энтероаггрегативных (EagEC) в кале пациента методом ПЦР. Обнаружение ДНК того или иного возбудителя свидетельствует о инфицировании данным возбудителем. Формат исследования — качественный.

Диареегенные E. coli (DEC), вызывающие острые кишечные инфекции (ОКИ), в зависимости от па- тогенеза, эпидемиологии и клинических проявлений вызываемых ими заболеваний, подразделяются на несколько патогенетических типов, входят в перечень инфекционных и паразитарных болезней, имеющих эпидемиологическое значение, подлежащих регистрации и учету, согласно МКБ 10 (А04.0 – А04.4). Классическими патогенетическими типами DEC являются:

• энтеропатогенные E. coli (EPEC);
• энтеротоксигенные E. coli (ETEC);
• энтероинвазивные E. coli (EIEC);
• энтерогеморрагические E. coli (EHEC);
• энтероаггрегативные E. coli (EAgEC).

Лабораторная идентификация эшерихиозов осложнена необходимостью верификации специфических патогенетических типов возбудителя в материале, постоянно содержащем большое количество авирулентных E. coli. Эффективное решение этой задачи, как правило, требует комбинации нескольких диагностических методов. Их спектр включает в себя выявление ДНК различных патогенетических типов E. coli как в биологическом материале, так и при исследовании чистых культур E. coli; детекция специфических метаболитов или антигенных детерминант, ассоциированных с определенными патогенетическими типами E. coli (наиболее часто – ЕНЕС).

Традиционным методом диагностики DEC являются культуральные исследования, включающие посев исследуемого материала на плотные питательные среды с выделением чистых культур микроорга- низмов и проведение их видовой и серотиповой идентификации. Исследование отличается специфичностью, обусловленной непосредственным выделением и идентификацией E. coli, включая чувствительность к антибактериальным препаратам.

В качестве скринингового метода исследования биологического материала для выявления нескольких групп DEC наиболее оправдано применение метода ПЦР с индикацией генетических мишеней конкретных патогенетических типов. Для выявления EHEC скрининговым методом может являться выявление шигаподобных токсинов методами ИФА или ИХА.

• Пациенты с симптоматикой острой кишечной инфекции
• Контактные лица в очаге эшерихиоза по эпидемиологическим показаниям
• Работники предприятий пищевой промышленности, общественного питания, торговли и др.

Специальной подготовки не требуется.

Кал. Кал собирается в пластиковый контейнер. До сбора кала пациент должен предварительно помочиться в унитаз. Далее путём естественной дефекации в унитаз или подкладное судно собирают испражнения. Затем кал забирается ложечкой в стерильный контейнер в количестве не более 1/3 объёма. Контейнер плотно закрыть. На этикетке контейнера указать Ф.И.О. пациента (или номер) и вид исследования. В направлении на исследование обязательно указать Ф.И.О. пациента, пол, дату рождения, номер пробирки (контейнера), вид материала и необходимые исследования. Материал должен быть доставлен в лабораторию в день взятия. До передачи курьеру, материал может храниться в холодильнике при температуре + 2 - +8ºС.

Кал

ПЦР Real time

Единицы измерения: тест качественный

Вид результата:

• Энтеропатогенные E. coli (EPEC) — обнаружены/не обнаружены;
• Энтеротоксигенные E. coli (ETEC) — обнаружены/не обнаружены;
• Энтероинвазивные E. coli (EIEC + Shigella spp.) — обнаружены/не обнаружены;
• Энтерогеморрагические E. coli (EHEC) — обнаружены/не обнаружены;
• Энтероаггрегативные E. coli (EagEC) — обнаружены/не обнаружены

G231 Микроорганизмы рода Шигелла (Shigella spp.); Сальмонелла (Salmonella spp.); энтероинвазивные E. coli (EIEC); термофильные кампилобактерии (Campilobacter spp.); аденовирусы группы F (Adenovirus F); ротавирусы группы А (Rotavirus A); норовирусы 2 генотип (Norovirus 2); астровирусы (Astrovirus); обнаружение и типирование ДНК (РНК); G233 Salmonella spp., обнаружение ДНК; G234 Обнаружение РНК ротавируса группы А (Rotavirus), норовирусов G1и G2 типов (Norovirus G1и G2), астровирусов (Astrovirus), энтеровирусов (Enterovirus)

1. Макарова М.А., Кафтырева Л.А., Коновалова Т.А. Эшерехиозы. // Лабораторная диагностика инфекционных болезней. Под ред. Акимкина В.Г., Твороговой М.Г. - Москва. ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора, 2020: 186-189.
2. Croxan M.A., Law R.J., Scholz R., et al. Recent advances in understanding enteric pathogenic Escherichia coli. /Clin Microbiol Rev. 2013 Oct; 26(4):822-880.
3. Sinha R., Rajesh A., Rawat S., et al. Infections and infestations of the gastrointestinal tract. Part 1: bacterial, viral and fungal infections. /Clin Radiol. 2012 May; 67(5):484-494.