ДНК Salmonella spp. в пробе пациента – свидетельствует о инфицировании сальмонеллами. Формат исследования — качественный.

Под сальмонеллезами принято подразумевать заболевания, вызываемые сальмонеллами, за исключением возбудителей брюшного тифа и паратифов. Род Salmonella (семейство Enterobacteriaceae), включает два вида (S. enterica и S. bongori). Вид S. enterica объединяет шесть подвидов и более 2600 серотипов.

Сальмонеллёз встречается во всех странах мира, но чаще в крупных городах в теплое время года. Преимущественно им болеют дети и пожилые люди ввиду низкой устойчивости к возбудителю сальмонеллёза. Сальмонеллезы характеризуются значительным полиморфизмом клинического течения с преимущественным поражением ЖКТ, возможной генерализацией и различной степенью выраженности симптомов общей интоксикации и обезвоживания.

Этиологическая лабораторная диагностика сальмонеллёзов включает в себя выявление культуры патогена, обнаружение антигена и ДНК сальмонелл, определение специфических антител к антигену возбудителя. «Золотым стандартом» диагностики сальмонеллезов является выделение чистой культуры патогена. Обязательным этапом исследований является биохимическая идентификация родовой принадлежности и установление серотипа изолята в реакциях агглютинации (МУ 4.2.2723-10). Средняя длительность исследования составляет 3-4 дня.

Обнаружение ДНК сальмонелл методом ПЦР являются наиболее быстрым методом диагностики. Информативность ПЦР-исследований достаточна для диагностики сальмонеллезов в клинической практике, однако не решает эпидемиологических задач – серотипирования патогенов. В острой фазе заболевания целесообразно применение прямых методов лабораторной диагностики – выделение культуры микроорганизма и его ДНК. При целенаправленном обследовании пациентов для диагностики сальмонеллеза предпочтение должно отдаваться классическим методам выделения микроорганизма (культуральные исследования с последующей биохимической идентификацией и серотипированием). При необходимости проведения исследований в короткий промежуток времени, а также при организации скринингового обследования для выявления широкого спектра патогенов целесообразна детекция ДНК микроорганизма. Определение специфических антител показано на поздних сроках заболевания.

• Энтерит, гастроэнтерит, энтероколит.
• Диарея.
• Обследование контактных лиц.
• Обследование работников пищевых предприятий, торговли.

Специальной подготовки не требуется.

Кал. Кал собирается в пластиковый контейнер. До сбора кала пациент должен предварительно помочиться в унитаз. Далее путём естественной дефекации в унитаз или подкладное судно собирают испражнения. Затем кал забирается ложечкой в стерильный контейнер в количестве не более 1/3 объёма. Контейнер плотно закрыть. На этикетке пробирки (контейнера) указать Ф.И.О. пациента (или номер) и вид исследования. В направлении на исследование обязательно указать Ф.И.О. пациента, пол, дату рождения, номер пробирки (контейнера), вид материала и необходимые исследования. Материал должен быть доставлен в лабораторию в день взятия. До передачи курьеру, материал может храниться в холодильнике при температуре + 2 - +8ºС.

Кал

ПЦР Real time

Единицы измерения: тест качественный

ДНК Salmonella spp.:

• обнаружена: инфицирование Salmonella spp.
• не обнаружена: нет инфицирования Salmonella spp.

G231 Микроорганизмы рода Шигелла (Shigella spp.); Сальмонелла (Salmonella spp.); энтероинвазивные E. coli (EIEC); термофильные кампилобактерии (Campilobacter spp.); аденовирусы группы F (Adenovirus F); ротовирусы группы А (Rotavirus A); норовирусы 2 генотип (Norovirus 2); астровирусы (Astrovirus); обнаружение и типирование ДНК (РНК); G232 Диарогенные E. coli, обнаружение и типирование ДНК; G234 Обнаружение РНК ротовируса группы А (Rotovirus), норовирусов G1и G2 типов (Norovirus G1и G2), астровирусов (Astrovirus), энтеровирусов (Enterovirus)

1. Рожнова С.Ш., Гусева А.Н., Павлова А.С. Сальмонеллезы. // Лабораторная диагностика инфекционных болезней. Под ред. Акимкина В.Г., Твороговой М.Г. - Москва. ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора, 2020: 179-181.
2. Besser J.M. Salmonella epidemiology: A whirlwind of change. /Food Microbiol. 2018; 71:55–59.
3. Gut A.M., Vasiljevic T., Yeager T., Donkor O.N. Salmonella infection - prevention and treatment by antibiotics and probiotic yeasts: a review. /Microbiology. 2018; 164:1327–1344.
4. Wattiau ., Boland C., Bertrand S. Methodologies for Salmonella enterica subsp. enterica subtyping: gold standards and alternatives. /Appl Environ Microbiol. 2011; 77:7877–7885.