Микробиота – совокупность микроорганизмов (бактерии, микрогрибы, вирусы), живущих в определенной локации организма. Самой многочисленной считается микробиота кишечника. Микробиота играет крайне важную роль в нормальном функционировании организма: регулировании иммунитета, синтезе витаминов, обмене жиров и желчных кислот, водно-солевом обмене, выведение токсинов и т.д, поэтому необходимо следить за балансом микробиоты – количеством и соотношением полезных и условно-патогенных микроорганизмов.

В основе метода лежит определение микроорганизмов по микробным маркерам (химическим соединениям из числа жирных кислот, альдегидов, стеринов), которые входят в состав клеточных стенок микроорганизмов или вырабатываются ими в процессе жизнедеятельности. У каждого вида микроорганизмов – свой уникальный набор жирных кислот, который можно определить методом газовой хроматографии с масс-спектрометрией.

Анализ микробиоты по Осипову включает в себя несколько этапов:

• Забор биологического материала. Для исследования может использоваться кровь, моча, слюна, кал и другой биологический материал.
• Подготовка образца. Биологический материал проходит химическую обработку для получения гексанового экстракта анализируемых веществ.
• Газовая хроматография и масс-спектрометрия. Образец разделяется на компоненты с помощью газового хроматографа. Разделённые компоненты анализируются масс-спектрометром, который определяет массу и концентрацию специфических маркеров.
• Расчёт результатов. На основе полученных данных производится качественная и количественная оценка микробиоты.

• Длительный прием антибиотиков
• Боли в области кишечника
• Изменения стула
• Избыточное газообразование

Взятие материала должно проводиться до назначения антибактериальных препаратов или через 2-3 дня после их отмены.

Кал собирается в пластиковый контейнер. До сбора кала пациент должен предварительно помочиться в унитаз. Далее путём естественной дефекации в унитаз или подкладное судно собирают испражнения. Затем кал забирается ложечкой в стерильный контейнер в количестве не более 1/3 объёма. Контейнер плотно закрыть. На этикетке контейнера указать Ф.И.О. пациента и вид исследования. Материал должен быть доставлен в лабораторию в день взятия. До передачи курьеру материал хранить в холодильнике при температуре +2 - +8ºС.

Кал

Газовая хроматография с масс-спектрометрией (ГХ-МС)

Результат исследования представляется в виде списка микроорганизмов и их количественной оценки. Исследование микробиоценоза методом газовой хроматографии с масс-спектрометрией позволяет оценить состав и количественные значения микроорганизмов данной локализации (биотоп толстая кишка), а именно резидентные микроорганизмы, транзиторные, абсолютные патогены, грибы, вирусы.

Результат исследования не является диагнозом и должен интерпретироваться врачом, в комплексе с симптомами заболевания, клинической картиной заболевания, анамнезом и данными других исследований.

N500 Анализ микробиоты (определение микробных маркёров) по Г.А. Осипову (кровь); N502 Анализ микробиоты (определение микробных маркёров) по Г.А. Осипову (моча)

1. Осипов Г.А., Быстрова О.В. Современный методический подход к неинвазивной оценке микроэкологического статуса человека и его отклонений от гомеостаза /Поликлиника. 2020; (1):18-20.
2. Осипов Г.А., Родионов Г.Г. Микроэкология человека в норме и патологии по данным масс-спектрометрии микробных маркеров. / Медико-биологические и социально-психологические проблемы безопасности в чрезвычайных ситуациях. 2013; (2):43-53.
3. Осипов Г.А., Родионов Г.Г. Микроэкология человека в норме и патологии по данным масс-спектрометрии микробных маркеров. /Поликлиника. Спецвыпуск: Лаборатория ЛПУ. 2013; (2)68-73.
4. Платонова А.Г. Исследование хромато-масс-спектрометрии микробных маркеров как перспективный метод изучения микробиоты человека// Терапевт.– 2022.– №9 – С. 20–24